研究院运营体系分为三大运营结构，各结构相互联系并相互作用，构建出创新、循环、可持续的内部生态。其中，核心资源承接部分，充分发挥了“三智平台”的资源优势，通过体系化的运作方式，把握关键节点，内生政策惠及力，为政策赋能园区产业奠定了坚实基础:运营体系搭建和集成机制保障部分在整体架构中承担了智慧中枢的角色，上承政策红利、理论成果、资源配置，下启服务保障体系，助推“三智”赋能园区产业结构优化;园区潜力挖掘部分，以研究院为核心承载，以园区生态、园区产业、园区企业为释能标的，以“内求”方式方法实现服务增值。
三大运营结构各司其职、各负其责、各尽其用进而构建出智慧、智能、智理的运营体系。
